1 村医身份模糊，老无所养：
是医不似医，似农不是农的尴尬身份，作为医生，他们肩负本乡农民的医疗保健工作，但是却无法享有医生相应的社会福利和待遇。因此由身份引发一系列困扰，最突出的就是村医养老问题，虽然各地都在探索解决之道，但至今无良策可循，这正是身份模糊所致的终极问题。
2 基药零加成，村医收入锐减：
基药制度是利国利民的政策，但是一直以来村医收入的60-80%来源于药品加成。推行基药制度后，地方政府本会进行相应的补偿。但是现实是，补偿不到位或补偿不足，使村医拿到手里的钱明显减少。村医中有为此转行的，有借钱苦苦支撑的，但有不少村医为了生计，仍不得不暗地里继续使用和卖非基药，以求补收入的缺口。
3 三无所致，村医青黄不接：
无编制与晋升、无培养与教育、无养老与保障是村医队伍的现状。中老年村医大多由赤脚医生转型而成，目前已成中老年人，由于老无所养，所以一直不敢言退休。而年轻人，较少主动选择村医职业，整个村医队伍显得青黄不接。
村医和社区医生一样，肩负着健康守门人的工作。但是村医与社区医生相比，享有的社会福利（编制、收入、待遇、培训、养老等）却差距甚远。
