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基因测序海外经验:技术及成本制约临床应用

2014-04-22 11:54:37 来源:每日经济新闻

每经记者 孙宇婷

《每日经济新闻》记者通过查阅医学资料,并采访相关人士了解到,即使在发达国家,基因测序也面临着一些争议,比较突出的几点是技术缺陷、检测误差、费用高昂等。但毋庸置疑,这场生物科技革命已经展开,随着临床应用技术的成熟,基因测序市场有望形成新的蓝海。

技术及成本制约临床应用

为好莱坞影星安吉丽娜·茱莉做基因测序的公司名为万基遗传,该公司在上个世纪末就被授予两大乳腺癌易感基因专利。据悉,这家企业在美国的乳腺癌检测市场处于垄断地位。正是依靠专利,公司获利不菲。据报道,万基有关BRCA1和BRCA2两个基因的检测每次收费3000到4000美元,2012财年占其总收入逾八成,盈利超过4亿美元。

但在2013年6月,针对万基遗传的相关基因专利是否有效,美国最高法院9名法官一致裁定,人类身上的基因不得申请专利。分析人士认为,这一裁决可能对生物医学界的发展产生深远影响,基因领域的一些研发型企业可以在现有技术的基础上加以创新,无需再担心专利持有企业的诉讼威胁;另外,从事基因药物生产的企业也将从中受惠。目前,人类2万多个基因中超过两成涉及各种专利。

2000年6月,美国白宫发布了关于人类基因组测序的第一份草案,从草案发布到首次投入临床应用,期间耗费了十年时间。2010年末,威斯康星州一个5岁的小男孩在接受了数次手术后,病情始终不见好转,命悬一线之际,依靠基因测序,医生发现了他身上的基因突变,并对症下药施以治疗,小男孩最终得以康复出院。

上述事例很好地说明了基因研究的意义,但目前基因测序在临床应用上仍有很多需要解决的问题。

美国医学会杂志 (JournaloftheAmericanMedicalAssociation)3月刊登了两则与基因测序临床医学相关的最新研究报告。

《每日经济新闻》记者整理发现,目前在临床上基因测序技术主要存在以下几个问题:其一,目前的测序技术并不总能捕捉到完整的基因组。相关研究人员发现,在已知与疾病相关的基因中,有10%~19%并未得到充分测序,这可能使医生们遗漏这些基因中的有害突变。其二,精准度不足。对于疾病相关基因中的增加或缺失突变,不同公司给出的结果有三分之二不一致。其三,相关临床解读及报告匮乏。其四,仍存在空白领域。例如对可能引起疾病的基因变异株进行分类还存在着很大的不确定,临床遗传学发现的复验性还未被定义。

另一个被广泛关注的问题则是费用。从第一次人类基因组测序算起,当时的测序用了13年,成本是27亿美元;到了2008年11月,许多人类基因组测序仅用了7~15天,花费了10万美元;2010年,基因测序龙头企业Illumina进行全基因组测序,成本降至28000美元。尽管相关开支持续降低,但基因测序仍被认为是一项奢侈的医疗检测。随着DNA测序技术性障碍的减少,当测序成本逐渐降至1000美元甚至更低时,基因测序才能被大众所接受。

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